Для 2.4GHz в частотном диапазоне чтобы точки не глушили друг друга обычно используют каналы 1-6-11 т.к. считается что частотные диапазоны этих каналов не пересекаются при ширине канала в 20MHz. В Channels создаем записи с Frequency 2412, 2437 и 2462. Далее в Configurations создаем три записи, различаться они будут только вкладкой Channel. Теперь создаем Provisioning для каждой точки, где в поле Radio MAC указываем MAC адрес Wi-Fi интерфейса, а в разделе Master Configuration (и Slave Configuration, по необходимости) указываем созданную конфигурацию. Аналогично делаем для 5GHz.
Комментарий к статье: MikroTik CAPsMAN, централизованная настройка и управление точками доступа Wi-Fi